Organigrama e Universitetit “Aldent”, me njësitë përbërëse të saj, e cila shpreh lidhjet dhe varësitë ndërmjet tyre, është miratuar nga Senatit Akademik dhe Bordi i Administrimit.
Përbërja strukturore dhe organizative e Universitetit, është si më poshtë:
- Pjesa akademike, e cila përbëhet nga:
- organet dhe autoritetet drejtuese akademike,
- njësitë kryesore (fakultetet)
- njësitë bazë (departamentet dhe qendrat kërkimore shkencore dhe njësitëndihmës-akademike).
- Pjesa administrative, e cila përbëhet nga:
- organet dhe autoritetet drejtuese administrative,
- njësitë e shërbimit.
Universiteti Aldent perbehet nga tre fakultete:
Fakulteti i Shkencave Mjekesore
Fakulteti i Shkencave Mjekesore Teknike
Fakulteti i Shkencave Dentare